mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTAGATTCACGCACAAACTCG CGTTTGTGCGTGAATCTAACA AGAAATGGAAAATCAGGAAGAGGCATATTTCACGTTTGTGCGTGAATCTAACAACCCTTTTCATCAGAAAAACTGTTGTTGTTTGCTAGATTCACGCACAAACTCGTAATATGTATTTTTCGAATATCTGCGCTT GCAGCCGCCGACTGCCGAACACCGGCTTCCATCGGCCCTTTTTCTCTAAACTTCTTATCCTATCTGAAGTTCGTGCAGACCAGAAATGGAAAATCAGGAAGAGGCATATTTCACGTTTGTGCGTGAATCTAACAACCCTTTTCATCAGAAAAACTGTTGTTGTTTGCTAGATTCACGCACAAACTCGTAATATGTATTTTTCGAATATCTGCGCTTTGATTTGTATCTATTTCTCCAATTGGTGCGACTCTGAAGTCTGACCTGACCTCTTTTCCCATCTGTGTTACTGCATATGTTTCCGTGCTCTATACTGATTTGATTGATTCTCATGTATCATTTGCATTAGCCACGAAGCTCTTCGGAAATGGATTGATGTTAATGGTACCAAGCTAGCTCAAGTGAAACACTCATAACTTCCTAATGAGAATTCAATCCCTTGCCGGCTGTGGAAGTAACTTCAAATTCATGAATTTGCTTTTGGAGGAAGATGGTTAATTTTGGTGTTAGCAGTTTTGTGAACTTTGTAAGATCCAGAAAAGGCTTAATGAGAAATATGTGCAGTATGCTTCTTGCTCCAAATTTGGGAATTCAACAATAAATAGTTGGGAAACATTGATGATTCAATAAGGCCAGGTTTTTTCAGCTTAGAGAGTACGTTGCTCAAGATAGTTACAACATTCTTAACAAACCCTTGGCTGTTTGATCTTCTCCTTTGCCGGAAGGTCTACTAAACGATGGTGCTTGCAATAGGTTCCATT 4 0 3' arm Solanum_tuberosum mirnest MIR403 0.0000005 tcc-MIR403a 0.0000004 -40.2 ......(((......((((((.(((((((....((((((((((((((((((((((..(((((....)))))...))))).......)))))))))))))))))....))))))).)))))).....)))...... (-40.2)