mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGTGGGCATACTGCCAATAG TTGGCATTCTGTCCACCTCC GTTTCATGGAGGTTTGACAAAGGTTTCTTACAGAGTTCATTGGCATTCTGTCCACCTCCCTCGGTTCTTTTTCGAAAAAAGGAGGAGGAAAGCAAGATTAATGTGGAGGTGGGCATACTGCCAATAGAGCTGTGTTGGTTTCTCTTTGTAAAACCCTCATGATACATCAAG GTTTCATGGAGGTTTGACAAAGGTTTCTTACAGAGTTCATTGGCATTCTGTCCACCTCCCTCGGTTCTTTTTCGAAAAAAGGAGGAGGAAAGCAAGATTAATGTGGAGGTGGGCATACTGCCAATAGAGCTGTGTTGGTTTCTCTTTGTAAAACCCTCATGATACATCAAGCAATATAGAGAGAATTAATCGCTCTCTAGCTAATTTTGATATGATGGTAAGTGTTCGATTGTAATAATAAGTAGTATCAGAGTCAAGGTCATGGATCTGAAGATGGAATTTATTATTATCTTCTTATTAGATTCATGACTGTCTCTTTGTTTTTTTCTTGAAGTAAACTGTCTTTACAAGGTATAGAGTAAGGTCTGTTTATATTTTATATCAAATTTTATCGGTATAATTTCACTGAGTATATTGTTATTGTACTATTAAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA 4 0 3' arm Solanum_tuberosum mirnest MIR394 0.00000004 ptc-MIR394b 0.000000000000002 -63.1 ((.((((((.(((((.(((((((...((.(((.((((((((((((...(((((((((((..((.(((((((((........)))))))))...........)).)))))))))))...))))))).))))).))).))....))))))).))))).)))))).))...... (-63.1)