mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAGTTCTTCAGCTGGCAGCT CTTGCCAGTGAAGAACTGATG AGCCAACCACAACAGTTCTTCAGCTGGCAGCTTTAGTTGGTACATATGACATAAAGCTTGCCAGTGAAGAACTGATGTGGGTCAG TATGAATATAATCCAATCTAATCCAGATACAATGTAGAAGCAAAAAATCCTTTGACATGCATGTTAATACATTTATCTCAGTTGCATCCATCTTAGTGACATAATGCTGTACGTTTCCTAGGAGTTGTTCCCCCTCCGCTTCACAAGTCACCTGGATGGAGGCGGAGAGAAATCTCACATGATGAGAGGGGTCTTGAGGTGCAGGAAAGAGCCAACCACAACAGTTCTTCAGCTGGCAGCTTTAGTTGGTACATATGACATAAAGCTTGCCAGTGAAGAACTGATGTGGGTCAGCCACGAGGCACCCAGAATGCACACACAAACTAAAACTTCACGCCTCTTCAGGGTGAGTCTTTGGGTGAAACCTCACTCATGGAAAC 1 2 5' arm Gadus_morhua mirnest mir-22 5e-21 dre-mir-22a 1e-24 -38.4 ......(((((.((((((((((.((((((((((((((((.......)))).)))))).)))))))))))))))).)))))..... (-38.4)