mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGGGTGGAGTAGTATAACAA GTTATAGTATCCCACCTACCC GCCCAAAGGATCTTCATTAGGGTGGGTGGAGTAGTATAACAATGTGCCCCATATTGTTATAGTATCCCACCTACCCTGATGTGCCCTAGCTAAG GACTCCAATGGCTACGGAATCGCTACGCCCAAAGGATCTTCATTAGGGTGGGTGGAGTAGTATAACAATGTGCCCCATATTGTTATAGTATCCCACCTACCCTGATGTGCCCTAGCTAAGGCCCTGAGCCACCTAGATAATGTGGTTTGTATAGAACCAAGGTAACCAGTCTTACCAGAGTAGATTAAAGCCCTTGCAATTTATTGTAAGTCGATAAATTGCAAAAATATATTTTTTATTAATATTTTTAAATGTAATTTATGATGAAATATTATATTATGGAATATATATAATGAGAATTATCATCCTCAATTGGAATTAATCATTCTATATGTAAGAACATTTTGCCTTCCTGATTTGAACTGATCACTAGTCATTCTATTGCTATCCTAGGTCCCAGTGTATCTCCAGCCAACTAACCTCTGCATCGTGTGTCTAACCCGTTAACCTGATGAGTGACTGAGTAGACTGTTGTTTCGACTGCATCACCTGTATAGACCTGTTAGATAGCAA 2 0 5' arm Gadus_morhua mirnest 100 rno-mir-2985 4e-25 -39.3 ......(((.....(((((((((((((((.(((.((((((((((((...)))))))))))).))).)))))))))))))))...)))....... (-39.3)