mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTCCTGCTGAACTGAGCCAG GATTATCAGTACAGCAGGCACAG ACCAGTCCTCTGTTCCTGCTGAACTGAGCCAGCTGACGTCGCACACTGATTATCAGTACAGCAGGCACAGGAGCCC GGATTCATTCAGATGTTTTATTTGCATCATCATCATTTGTTTAGTGGTATTTTTCCTGTCCTTCGTGCTTTATTATACAGTTACAGGGCTATTATGAAAGGCAATATTCATAATATCACAACAACCTTGATTTGAATGATATGTGTAATATAATATAATAAATATCTCATATTTCACAAAACACATATACAGTATAATATATAACCTAAAACATCAAATTATAGTATTATGTATTTTTGTTCAAGTGTCAATATATACATTACTCAAATACACAAAGCTATTTTCTCAGGCATAAAGTATGTACAATTATACGTGTGTTCAGTCTTAACATTTGATTACTTGTGTGGCAGTTGATTCATGCTGGATATATAGTTGTGTGACGGCACGTCTGTCTGACTGTATGGATGTGTTTATGTTAAATATATAAATACATTTGTTCTGAAGTTGTTCACGTGTCAGTGTTGGTGTGGATGTGTGTGCATATAATAATAATAATAATAATACTAATAACAATAATACTATGCGTTGTGTGTGTTAGTGTTCCTCCCATGGTTTGGAGCAGTGAGACCAGTCCTCTGTTCCTGCTGAACTGAGCCAGCTGACGTCGCACACTGATTATCAGTACAGCAGGCACAGGAGCCC 4 2 5' arm Gadus_morhua mirnest mir-24 3e-22 fru-mir-24-2 4e-24 -24.7 ........(((((.(((((((.(((((..(((.((......))..)))....))))).))))))).)))))..... (-24.7)