mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACTTGTCCCGGCTTG GGTTGGGAGAGGTGACAATGCT CTTTTCTGTGCAGGTTGGGAGAGGTGACAATGCTCTGTTTGGGATGGTATTGCACTTGTCCCGGCTTGTTGAGGACT GGGGAGTATTAAGTGCTTATAGTGCAGGTAGTTGTATGTATTTCTACTGCAGTGTGAGCACTTAAAGTACTTCTAGAGGCGTACATCGTCGCGTGGTGGAGCTTAGGACTGCGCTCTGTGGACAAGGGTCTCTGGTTAGTTTTGCTGGTTTGCTTTCAGCTTTTGAAAACACACGCTGTGCAAATCCATGCAAAACTGATCATGGCACTGATAAAAGTCTGGTCGAAGCCATCCCTTTTCTGTGCAGGTTGGGAGAGGTGACAATGCTCTGTTTGGGATGGTATTGCACTTGTCCCGGCTTGTTGAGGACTTGGGGAACGTAGCTGCCTCCTTCGTCCTCCCTAACCTCGGAACTCCCAAGAACTGAACTGCTGTCCTCATTGCGCATTACGTTTGACTTGTTTGTTTAATAAAAAAAATGTATTGTAATTTAATTGTTTGTTACTTGTGCAACGGTCAAAGCTATAAAAAAAATGACAATTTAAATAAAGTTTGTAAAATACACCG 1 1 3' arm Gadus_morhua mirnest mir-92 8e-23 oan-mir-92a-2 0.00000001 -31.5 .(((((...(((((((((((.(((((.(((((((((.....)))..))))))))))).))))))))))).))))).. (-31.5)