mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATATGTTTGATATTCGGTTG ACTAAATATCAGACATATTCCT TCATATAAGCTAGAGGCTGTGTGATATGTTTGATATTCGGTTGTTCTCCTGCGTTTTCACGTCAACTAAATATCAGACATATTCCTACAGATTCTGGCACGTTA CCATTACGGCCGGGGGACACATTCATACATTCAGGCAGCACTGATGGACGATGGGACACTGACAAATACAACTCATACATGGAGTTTTCACCATTTTGGCTCTAACATTACATTAGCAAATCTAATGAAGATGTTGTTTTTTATCTATTTAACCTTTTTTTCATGAGGTTTCATTAGGTTTAATCATCTGTTTTGCAAGATACCTGACACACAACATACTTTAACCTCACAACAAGACATATTTAGGCCTCAGATTTTTGACAAACAGTATTGAGTAGGAAAAAGGAGGAGGAAAGAAATGGACCTGGACAAAGCGATGTGGTCTATCAAGTTATGAAGCACTCCTGGAATTAACTTCAACACCAAGCAATACTTTATCGAACTGCAAGGAATCATATAAGCTAGAGGCTGTGTGATATGTTTGATATTCGGTTGTTCTCCTGCGTTTTCACGTCAACTAAATATCAGACATATTCCTACAGATTCTGGCACGTTAACATCACCTTGATCCAGCTCACCAAAACCAGAACATCTGCATACATTATGTGCTTTATTTGTCCATTTTGTTTCTTACTTATTTTAGACCATATGTAATCCTGTTAAT 2 0 5' arm Gadus_morhua mirnest mir-190 3e-26 dre-mir-190b 0.000000001 -35.2 ........(((((((.(((((.(((((((((((((((.(((((.......((((....))))))))).)))))))))))))))..))))).)))))))...... (-35.2)