mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCTCAAGAGGGATAGCGCC AACGCTATCCATCCTGAGTTTCA CCTATAGAGTGGAAGAATCTGTATAGCTCAAGAGGGATAGCGCCACGAAAGCATCGGCGATGATCCGTTGTTTGTGAAGAGTTTTTATGCTCTTTGATTTTCTGTAACGCTATCCATCCTGAGTTTCATGGGTTCTTCACACTGCTTC CCTATAGAGTGGAAGAATCTGTATAGCTCAAGAGGGATAGCGCCACGAAAGCATCGGCGATGATCCGTTGTTTGTGAAGAGTTTTTATGCTCTTTGATTTTCTGTAACGCTATCCATCCTGAGTTTCATGGGTTCTTCACACTGCTTCTAATGAATCTTTGGATTTTTTTTTTGGGATGTGTGGATGAATATGTTCTATGCTTTCTTCATAAGAAGAAGAAAAACGTAACACCAATATTGGATTATTGGTCCCTCATAATAATCTTGCACTATACAAGCTTGGTTAGAATGAATATGGAAAAAAATGGTGGAGAGAAAAAAAAATAGGTAAGGCTATAGATTATCAAGTTC 4 0 5' arm Arachis_duranensis mirnest MIR390 0.0000001 csi-MIR390 0.00000003 -49.3 .......(((((((((((((((..((((((.((.((((((((.((.(((((((.(((((......)))))..)))(((((((......)))))))..)))).))...)))))))).)).))))))..))))))))))).))))..... (-49.3)