mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCTGCTGACTCGTTGGTTCA ATTCAACGATGCGGGAGCTGC AATTTAAATTATGTAAGGGTTACGAAGGGGCTCACTTCAGTCCAGTCCGCGGCGGTAGAAGGCTGTGACTCAGCTGCTGACTCGTTGGTTCAAGAGTTCACCATTTAAGGTCAATGTCAGCCCATGAAACAGTTAAGGTTGTAACAGTTAAGGTGGTGCGCTTCTGATTCAACGATGCGGGAGCTGCATTCGGCCGTCACTGTCACGTCTTGGACTGAAGGGGCCTCTTCATTTCCTTTATCTGTTTGGCTCCTG GGGTACTGTGTCCAAACATGTTAATGTTTGTCACTCCTCTCTCTCCCTCCTTCGCCTATCTCTCTTTCTCTGTGAGACCCGTTTTCTAATGTTTTGCTAGAAGTCTAGCCATCTTTGAATATAAATGTTAATTCTATGTTTTTATTTTCTATTAGACTGCACAGTAAGGTTTGCATTGCTTTGTCCATGGGTGGTTTTTTCTTTGACAAATGCAGTGCTATAGAGTTTCTGTGCTACAAATACTAACATGCATGTGGTTGTATAGAGTATGTGATGAGAAAACGAATTAAATTTAAATTATGTAAGGGTTACGAAGGGGCTCACTTCAGTCCAGTCCGCGGCGGTAGAAGGCTGTGACTCAGCTGCTGACTCGTTGGTTCAAGAGTTCACCATTTAAGGTCAATGTCAGCCCATGAAACAGTTAAGGTTGTAACAGTTAAGGTGGTGCGCTTCTGATTCAACGATGCGGGAGCTGCATTCGGCCGTCACTGTCACGTCTTGGACTGAAGGGGCCTCTTCATTTCCTTTATCTGTTTGGCTCCTGTTTGGTTTTTTTTTACCAGGTATTGCCATGAAGGTTGCAAATGGTCGATTCGAGATTATCAAACAGTTTTATTGAGATTACAGTTGCGATGAGAGGTATAGGCTGAACTTGTTATTTTACCTTTTTGATCTTGTAGTTCCTTTTTGTTTTATTGTATGTTAGAGTACTTTCTGTTACAGTATATTCACTTGTTATCGGTATTTTATGTTGATAGGAATTCTTCTGCAGCGGCTGAAGGAGACTCTTGTTTAACTGCTGA 4 0 5' arm Vigna_unguiculata mirnest MIR159 1e-21 rco-MIR319b 2e-16 -95.8 ...((((((...(((((((....((((((((((.(((((((((((..((.((((((.((.(((((.....(((((.(((..(((((((.(((.((((.((((((((.((.....((((((((..(((.....))).)))))..))).)).)))))))).)))).))).)))))))..))).)))))....))))).)))))))).))..)))))))))))))))))))))....)))))))..))))))...... (-95.8)