mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGTGTGATGATTTGAAATA CTTCAAATCTTCAGCACTCGGG GAAGCATCCTTTGAGTGTGATGATTTGAAATAAACCTTCAAATCTTCAGCACTCGGGGCTTTCTT AATCTGCACAGTGGTCATACAGTGTTTTTGTTCTCTACTCCCCCTGCAGTGCACAATGCACCTCAGAAACACTTGCTTGGTTTTGAGAAAGTTCAATTGATGGGAAAATCAGAAACACTGGTTAGGTTCAAAGTAGATGTTTGTAAAGATTTGAGTATAGTTGATGAACTTGGCAACAGAAAAGTTGCCTTAGGACAGCATCTGCTTCATGTGGGGAATTTGAAGCATCCTTTGAGTGTGATGATTTGAAATAAACCTTCAAATCTTCAGCACTCGGGGCTTTCTTTTGTTCCTTTCGGGAAAAATTTAAAGGGGACCAGAAATAAGTTTGAGGTAATTGTAGCAAATTCTCTTATTTCTTCTTGTTCAAATACAAAAATTTGAAATGCTTTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAA 4 1 5' arm Vigna_unguiculata mirnest 100 100 -21.9 (((((.....((((((((((.((((((((.......)))))))).))).))))))).)))))... (-21.9)