mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATATAGCATCGTGAGCAATCA ACTGCTAACGATGTTATATCA TCATGAATACTATATAGCATCGTGAGCAATCAGCCTTTTTTCATTATCACAGATTGACTGCTAACGATGTTATATCATCCACAAT TTTTTTTTCTTTTTTTATTGAGTTAACCTAATTAGATTAGAAAGGACAATACATGATGATAATAGTAATAATATAATGGATAAGATTTTTCAATTTGGTAAATCATGAATACTATATAGCATCGTGAGCAATCAGCCTTTTTTCATTATCACAGATTGACTGCTAACGATGTTATATCATCCACAATGAAATTTCTTCCATGTTGTTGCCATGTTTATGTGTTAAAATCCACTTCCATATGCTGGTGCCCAGTAATCAGCTCCATTTTCATTTCCAACATGTTGGGTACAAGACACAGGAACCAAGCACAACCCTCTACTCCTCAAGTCCTTTGCCTTATCTTTTCCATCCTGGTTTGGAGCTCCCTTTCTTTTCAGGCCATTGTCATTCAACAGCTGACCGGGGTCCTCAGGAAATACAGAATTTCTTTCTCCATGTACAGACTGTGGATTCCTCATGTTTTTTGATCCATTGCCCAAGTAAGGAGAACTCAGTGCCTCAATTTGACCCTGAAGGAATCTTATGTATCCAATGGCTTCTAACAAGACAGAAGCTGTGTCAGTCTTTCCGAATGGGGAAACTAGCTGGTGAAGAGCTGTTATTCTATCTCCTAGCTTCTCCTTTCTCACCTTGAGAGGTGGTTGGCTTGAAGATGGTTGACTCTTAGTCTTCTTGTAAACTCCAGCAGTTGCTGTG 2 0 5' arm Vigna_unguiculata mirnest 100 100 -21.7 ...........((((((((((((.((((.((((.((..............)).)))).)))).)))))))))))).......... (-21.7)