mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTAATGCTTCCTATTCTC GAATAGCAGCAATGGGTATT ATTCCTCAAATCAGAATAGCAGCAATGGGTATTTGTACAGTTCAGCCTATCCCTCTCTCGAAACTTCCTAATGCTTCCTATTCTCTCCCTAAGCC GGACCGCATTCCTCAAATCAGAATAGCAGCAATGGGTATTTGTACAGTTCAGCCTATCCCTCTCTCGAAACTTCCTAATGCTTCCTATTCTCTCCCTAAGCCCTCTCTTTCTCGCAGAGTAATCCTTACCACTCCCACCGCCACACTTTTTTCTCGATCTATTTTCTTGAGAAATTTGTTGCCAAGGGCTACACCTTCCGAAGAAATATCCGGTGGGTCAAGTCAGTTTTTCAATGAGAAACGCGATGTTGTGATAACCCTGGAAGAGGGTAAAGCTGATGATAAAAAGGAGTTGGAAGAAACGGTGAACGAAGACGCAAGAAAAGAGTTACCAGAAGAAGGACCGAGTTTGTCTTTTGATTTCCTGGATAAGTTCAATCTTGACACAAATGACACTGGTTCCATTGTCTTGTATGGAGGTGGTGCCTTGACGGCTCTGTGGCTAACAACCGCAGTTGTTGGTGCAATTGATTCTATCCCATTGTTCCCTAAGTTGCTGGAAGTTGTTGGGCTTGCATACACAGTATGGTTCACTTCCCGATATCTGCTTTTCAAGCAAAGTAGAGATGGACTGTCTACTAAAATAGAGGAGCTAAAGGAGCAGGTTTTTGGTTCAGAAGATAATTGATTTTTGTGTTTCCACTTCATGATTGTACAGTTGCTTCTGGTTTAGTCAGGGGAATGTGATATTAGTCTGCCCCTTGGTGAGCCTTTCCTCTATATGCAGCCTCCCATTAGTGTTGGTTGAGAATTAA 5 1 3' arm Vigna_unguiculata mirnest 100 100 -13.3 ............(((((((.((((.((((.....((....(((................)))))..)))).))))..)))))))........... (-13.3)