mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCGCCTTGCATCAACTGAAT TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA AGTGGATGTGATTAAGCAGCAGATTTTGATTCTATCACTGTGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGGTTTCTGCGCGAAATGGTGAAGTGGTAGCCGGCGGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGGCCGCAGTGAGGGTTTTTGTCGATGTCTGGTTACACCCGCTCAGA GGGGTCACCACATAGGGTGGGTTGGGGGTTGGCTTCGTCTTCTCTCTTCGCCTCTTTCTCTCTCTACCTCCTCCCTCTTGGATGAAGAGAGAAAGTAAAACAGACGAGAAATTTGTTTGGTGGTTTACCAGTGAAGTGGATGTGATTAAGCAGCAGATTTTGATTCTATCACTGTGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGGTTTCTGCGCGAAATGGTGAAGTGGTAGCCGGCGGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGGCCGCAGTGAGGGTTTTTGTCGATGTCTGGTTACACCCGCTCAGATCTCATCTCCCAGATTCTACTATCAGTTACTTCAGATTGATTGATACTTTCTTTTGGGGAATGGAAGGTTTAAATTTATGAAGTGGTGAACTTATAGCATATGATGAAGGCATGAAAGGCTTGTTAGGGACCCTAATTTTCAGTGGTATCAGCTTTTTGATTATAAATACTTAGTTTAAATTTGCATTTTAGCTATTCAATTGTTGGAGGGGGACTAATCCCTCTCTTCTAGCCAATACCAGGGAAAGACTTCCTCACCAATTCAATTCATAAGCTAAACAGAAGTTACAGAATACGAAGTTGT 2 0 3' arm Vigna_unguiculata mirnest MIR168 1e-17 gma-MIR168 6e-44 -82.3 (((((.((((((((.(((...(((...((..((.((((..((((((((((.(((((.((((((((((.(((((.((((((..(((.((...((((.........)))).))))))))))).))))).)))))))))).))))).)))))))))))))).))..)).)))..))).)))))))).))))).... (-82.3)