mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CCCGCCTTGCATCAACTGAAT GAAGTGGATGTGATTAAGCAGCAGATTTTGATTCTATCACTGTGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGGTTTCTGCGCGAAATGGTGAAGTGGTAGCCGGCGGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGGCCGCAGTGAGGGTTTTTGTCGATGTCTGGTTACACCCGCTCAGATC GGACGAGAAATTTGTTTGGTGGTTTACCAGTGAAGTGGATGTGATTAAGCAGCAGATTTTGATTCTATCACTGTGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGGTTTCTGCGCGAAATGGTGAAGTGGTAGCCGGCGGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGGCCGCAGTGAGGGTTTTTGTCGATGTCTGGTTACACCCGCTCAGATCTCATCTCCCAGATTCTACTATCAGTAAATTTTTATTTTTATTTTTTAATTTACTTCAATATCTGCTTATCAGATCCAGTTATAGATCCCGATGCCTAGAATCTACATCTAGAAAAAACATTTTTCAGTAAGCTTCTGGTGTGTTTTTTTTCCTGTTTGAATTTTTTGACTACTTGAGGTGCTTCTTTTCATTGATTATGTGGGGAAATTTTTATTCAGATTGAAAT 3 0 5' arm Vigna_unguiculata mirnest MIR168 1e-17 gma-MIR168 6e-44 -82.6 ..(((((.((((((((.(((...(((...((..((.((((..((((((((((.(((((.((((((((((.(((((.((((((..(((.((...((((.........)))).))))))))))).))))).)))))))))).))))).)))))))))))))).))..)).)))..))).)))))))).)))))...... (-82.6)