mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGAGTGAGCACACAGAGGC TTTTGCGTGCTCACTTCTCTTTC GAACATAGAAATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGCACCTGGTATAGTCATACACTGTTACTTTTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAACTTCCAGTGC GATCTCATACGTGTCATTGGGACGTGTTGCATGAGTAAGGGCTTTCTCTTACCTTTCCCACAGTCTGTGCTTTCACCTTTCATCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCTCCATTCCATCATGTTACTTTTCTTAACAAGTATTTTATATCAGTTAAAACATGTCTTTTTATTCTTTTACCTTTTAATTTAATACACCTGTTAGTTAGTTTTCCTTTTATAATTTTGAGATGTTCTTGATAGTTATGAATAATCAAACCCTAATGGATCTTCCAGTAATTGAATTGTGGATGAATAAGATGGTGTGTGGGAGGTGGCGTGGATCGTATATAACAGTCCTTGGTTTTTCCTTTAATGGGTGTCTCTCTATTCTTCCAGATCTGAATGAATTCAGATTTTTTTCCCCTTTTGATTGCTGAAATCCACTTTTCCTTTTCGTGAAGCTTTCCAAATTTGGTGAGTCATTTTGTTTTTCCGCTTTGTTTTTGTTTCTTGGAACATAGAAATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGAGGCACCTGGTATAGTCATACACTGTTACTTTTGCGTGCTCACTTCTCTTTCTGTCAACTTCCAGTGCTGGAAATTACTTCCAATCTGGCTCTGCTTTGTTCCAATTCCCACCAAACAAACCCCAACTCAACCCCACACACCACCTCAACTCAACAACAACAACAT 2 2 5' arm Vigna_unguiculata mirnest mir-156 0.000000000006 tcc-MIR156g 2e-27 -37.2 .......(((.(((((((((((((((((((((.((((((....((((.((....)).))))...)))))).)))))))).)))).))))))))).)))...... (-37.2)