mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCTTGATGATGCTGCAT GTAGCATCATCAAGATTCA TCACAGTCGTTGTTTGCGGATGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAACGAAGGTGGATGGGACTGTGATGCAATCTAACCGCTCGTCTTTTTGATGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCCATAAACGACTTTA TTTTGGCTTTTCTTTTGTTCTTGAGGTATGAATCGAGTTCATGTGGTTAGATTCCATTCGGGGTACCCAACTGGCCTCGTGTGGCAAACACAAACCGACCACTTAGAACAGGCCACATCAGCGACTCCTCGTGGCCTTGCTGCTAAAATTCCACATAAAATCTCAATTTTCCGTGTCCCCTCTTTCTTTTCTATTTTTTACCCTCTCTTGCTTTCTCTCTGTTTCATGTTGTTCACCCTTTTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTGTTTTCCCCATGGACAAATTTCCGTGACATTAACTGGTCTTCACTATTGGAGTAACCTATTGAGCTTTTTAGCCATACATACGTTTCACTAAAAGTGGTAATAATGCTTTATAGCTTCTAAATATATACACATGTCTATGTATGTGCATTCCTCTCTTTTTCAGAAGCTATAGTTGCATGGACAGATTCACAGTCGTTGTTTGCGGATGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAACGAAGGTGGATGGGACTGTGATGCAATCTAACCGCTCGTCTTTTTGATGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCCATAAACGACTTTAAAAAGTTGAACAAGTACTGCAAGTAGAGACCCCTCAATCAAAGAGAGGGAGATAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAA 0 2 3' arm Vigna_unguiculata mirnest mir-172 0.000000000009 gma-MIR172b 4e-38 -56.8 ....(((((((....((.(((((((((((((((((((((((((.((((.((.(((((...(((.(((...))).)))..)))))..))..))))))))))..))))))))))))))))))).))....)))))))... (-56.8)