mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTAGCATCATCAAGATTCACA TGAGAATCTTGATGATGCTGCAT TTCACAGTCGTTGTTTGCGGATGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAACGAAGGTGGATGGGACTGTGATGCAATCTAACCGCTCGTCTTTTTGATGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCCATAAACGACTTTAA TTTTGGCTTTTCTTTTGTTCTTGAGGTATGAATCGAGTTCATGTGGTTAGATTCCATTCGGGGTACCCAACTGGCCTCGTGTGGCAAACACAAACCGACCACTTAGAACAGGCCACATCAGCGACTCCTCGTGGCCTTGCTGCTAAAATTCCACATAAAATCTCAATTTTCCGTGTCCCCTCTTTCTTTTCTATTTTTTACCCTCTCTTGCTTTCTCTCTGTTTCATGTTGTTCACCCTTTTTTATTTATTTATTTATTTTTATTTTGTTTTCCCCATGGACAAATTTCCGTGACATTAACTGGTCTTCACTATTGGAGTAACCTATTGAGCTTTTTAGCCATACATACGTTTCACTAAAAGTGGTAATAATGCTTTATAGCTTCTAAATATATACACATGTCTATGTATGTGCATTCCTCTCTTTTTCAGAAGCTATAGTTGCATGGACAGATTCACAGTCGTTGTTTGCGGATGTAGCATCATCAAGATTCACATGCAAACGAAGGTGGATGGGACTGTGATGCAATCTAACCGCTCGTCTTTTTGATGTGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCCATAAACGACTTTAAAAAGTTGAACAAGTACTGCAAGTAGAGACCCCTCAATCAAAGAGAGGGAGATAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAA 0 2 5' arm Vigna_unguiculata mirnest mir-172 0.000000000009 gma-MIR172b 1e-38 -56.8 .....(((((((....((.(((((((((((((((((((((((((.((((.((.(((((...(((.(((...))).)))..)))))..))..))))))))))..))))))))))))))))))).))....))))))).... (-56.8)