mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTGGTTCTTGGCTACG AACAGAGAGTGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGTTATGCTGCATGATGCTTTTTACGGCGACTTTGCCGGCAAGTGGTTCTTGGCTACGTTTGGCTCTTT AACAGAGAGTGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGTTATGCTGCATGATGCTTTTTACGGCGACTTTGCCGGCAAGTGGTTCTTGGCTACGTTTGGCTCTTTTCTTCTCATGTAAATGCTGCCTGGGACCAATTATTGCATCAGAAACTCCTTCACTTGCAGAACTTGCATACACTGCGGAAATATTGTGGTAAGTAGCCAAACTTGTGTTTTTGTGAAGAGTTTGAATATGTTAAATGTCCTTTTCTGTCATGTTTGTTTCCTTGAAGCTGCACTTATACAGGATTTTTGTTTATTTCGTTGAGAAAGATATGTAGGGAGAAACGGTGTAAAAGTAAAAGCTTTGTGTGGAAGTGTAAACTATGGACACTTGAAAGCTATTATGCAGAACAAAAATGGAAAAACATGAATGAGTTCTTTATGCTTTAATCTTAACATAGGATTTTGTATTTGTTTTTCCTTTTGTTGTTTATTATATAAATTGGTTTCTGCAGTGAAAACAATAGTTTTTTTGGTATATTGTTTGACAGAGAGGTTGTGCATGTACGTGTTTTCTAGTGTTCTGCTTAATTGGCGTAGAGATCAAGATAATATGTCAGCATACAGCCAGGCCAAGAAACAGAGAATTGAAATTTTGAACTTTGAACAGGTAGTCCATTCATGCCATACATTATTGTCATTTT 2 0 5' arm Vigna_unguiculata mirnest MIR169_2 0.000001 gma-MIR169a 0.000000000000006 -47.5 ....((((((((((.((((((((((.(((((((((((...(((((..............)))))....))))))))))).)))))))))).))))..)))))). (-47.5)