mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTGTGGCATCATCAAGATGC TTTTGGCTCTTGCCAGGCCAA GAAAGTGCTTTGGTGTGGCATCATCAAGATGCGGACCCTGATTTTGGCTCTTGCCAGGCCAAAGAATTGT ATGCATGATTCAGAGAAGCAATTGAGGCACGAGAAACACTATCGGTACATCAGTTCTCATGATGTGGCGTATTGGGCACGCAGCTTTATGCAGGATTTGGAGAGAGCATGCAAAGATCATTACACCAAAAGGTGCTGGGGAATGGGTTTGGGCCTAGGGTTTAGAGTTGTTTCTCTTTCTCCTGGTTTTAGAAAATTGTCTGTTGATCACATTGTTTCAGCATACAAAAGAACTGATAAACGAGCTATATTTCTTGATTATGATGGTACTATCGTATCAAAATCTTCTATAAACAAGACCCCCAGCCCTGAAGTCATATCCGTGCTAAATGACATGTGTAATGATCCTAAAAATACACTCTTCATTGTGAGTGGAAGGTCAAGAGATTCTTTAAGTAATTGGTTTAGTTCATGCAAAATGATTGGACTTGCTGCCGAACATGGATACTTTTTAAGGTGGAACAAAGACTCTGAGTGGGAAACCAGTCACTTGTCTTCTGATCTTGATTGGAAGAAGATTGTGGAACCTGTCATGCAATTGTATACGGAGGCAACTGATGGATCTAATATTGAAACTAAGGAAAGTGCTTTGGTGTGGCATCATCAAGATGCGGACCCTGATTTTGGCTCTTGCCAGGCCAAAGAATTGTTAAATCATCTGGAAAGTGTCCTTGCCAATGAACCTGCAGTTGTCACCCGGGGCCAACATATTGTTGAAGTCAAGCCACAGGGGTTAAACAAGGGCCTGGTAACTGAAAAGATTCTTTCCACTATGGTTAATGGTGGTAACCCCCCAGATTTTGTTATGTGTGTGGGAGATGACATTTCCGATGAAGACATGTTTGAGAGCATATTAAGACA 5 1 5' arm Vigna_unguiculata mirnest 100 100 -22.4 ...(((.(((((((.(((((...(((((((.(((...))))))))))....))))).))))))).))).. (-22.4)