mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGGGCAACATAGGGAGACAT GTCACTCTGAAACTCAGGC TTTACTTTTTTAGGGACATGATGTCACTCTGAAACTCAGGCTGGAATGCACTGGCATGGTCATACCTCACTGCGGCCTCAAACTGCTGGGCTCAGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAATTTGAAGCCACCCTGGGCAACATAGGGAGACATCATCTCAAAACAAGAAGCT AAGATTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTGGCTCAAGTCCTATAGTGTATTCATGTGTCCTGAAGTCCAGAATTCTGTAGGATAGTGTCCTACATTATAAGCCTGGAGGAAGAAATCATAATTCTTTAATTTTTACTTTTTTAGGGACATGATGTCACTCTGAAACTCAGGCTGGAATGCACTGGCATGGTCATACCTCACTGCGGCCTCAAACTGCTGGGCTCAGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAATTTGAAGCCACCCTGGGCAACATAGGGAGACATCATCTCAAAACAAGAAGCTATAATAGGAATAAAACAAATAATCAAAGATTTCCTTGAAAAGGGATTGATTATCCCTTCCACCAGTCCTAATACTCCCATCTTCCTGACACAAAACCTCACAGGGAAGGATGAAGATTTGTACAAGATTTGAGAGCTATTATTAATACTACTGTGATTCCTCATCAACCAGTAGTTCTAAACCCCCACACTCTTTTATCCAGCGTACGTGTAAACTGTGAATATCTTAACTGTTAATGATTTATGCAGTGCTTTTTAGGCATACCAATACACCCTAACAGTATTTGTTTGTCTTTACCTAGATTGGATATCAATATATCTGTACTGTTGTGCCTCAAGGTTATACCATAGGCCCAACTTATTTTTCACACATATTAAAGACTGACCTAGCTTAGCTAAATTTCTCTTGTTATGCTTCTCCAATCTGCATAATTGTAAAAAGGACTCCTTGTACT 4 2 3' arm Macaca_fascicularis mirnest Metazoa_SRP 0.0000002 100 -55.1 ....(((.(((.((((..(((((((.(((((...((((((.(((.((((....))))((((............))))(((((...(((((((((((.......)))))))))))...)))))..))).)))))).....))))).))))))))))).))).)))..... (-55.1)