mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGGGCAACAGAGCGAGACTC GTCTCGCTCTGTCGCCCAGGC TTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTAGAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGTCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCTAAATAAATAAAT CCCGGGCTGCAGGGAATCGAATCGAATTCGTTAGGGTAGATGCATTTTTCTGTCTAGGTGTTATATTTTAATTACAACAATTTTATATTTCCTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTAGAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGTCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAGATAAATGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 3' arm Macaca_fascicularis mirnest Metazoa_SRP 2.0E-21 hsa-mir-1273 4.0E-7 -60 ..(((.(((.(((.((((.(((((((((((((((.(((((((((.(((((((.((.........)))).))))).))))))))).))))))))))))))).)))).))).))).))). (-60)