mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAGCTGTGGAAACTGAGGCA CTGAGTGTCCACAGCTATTC TAGGGCTCTATGCTGAGTGTCCACAGCTATTCTTTAATCTTTATAACAGCCCTGGGACGCAGGCACTATTATTAACCTCATTTTACAGCTGTGGAAACTGAGGCACAGAGACGT ATTCGAATTCGAATTCGAATAGGGCTCTATGCTGAGTGTCCACAGCTATTCTTTAATCTTTATAACAGCCCTGGGACGCAGGCACTATTATTAACCTCATTTTACAGCTGTGGAAACTGAGGCACAGAGACGTTAAGTGACCTGCACAAGATCGCAGAGCCAGGATTCAAACCCGTGAACTGTGGGCCACTCAGTCGCCATGCTGTACCGCCGTGCAGAGCAGAGGAAGATTTGTTCTTGTTCTCGTTTATATTAAAAGTGAGAAAACATGGGCCACGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGATGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAGCAGCCTGACCAACATGGTGAAATCTGGTCTCCACTAAAAATACAAAGATTAGCCAGACATGGTAGCTCGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAAGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGGGCCAACCTAGGCAACAGAGCAAGACTCCATCTCCATAAAAATAAAAAGGTGACAAGAAACACTTAGGATGGCTGAGAAATGAAAGGACAGGGTGAGAATTGCAAACATGCG 4 1 3' arm Macaca_fascicularis mirnest mir-633 7.0E-9 100 -32.2 .....((((.((((.(((.(((((((((..............((((.((.((((.....))))..)).))))..............))))))))).)))..)))).)))).... (-32.2)