mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGGCGTGGTGGCGGGCGCCT GCATGCGCCCCCATGCCCAGC ACGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAGAAGATTGGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTGGTCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGATTGCGGGCATGCGCCCCCATGCCCAGCTGGTTTTTGTGTTTTTAGTGGAGACGGGG CATCCTCCCTGAGGGCCTCCCCTGCACTTTGGAAACAGCCCAAGCTTTGAAATCAGGAAGTTTGAAGACTGGTTCTGCTACTTCCAGGCTGTGTGGCCTTGGGAGAAAATGTTTTCGCTGTGTTGCCTGGGCTAGTCTCAAACTCTTGGCCTCAAGTCATCCTCTCACTCAGCCTCCTGAGTATGAGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCCAGCTTCTTTAAAAAGAAAAAAAAAAGTTGTATTGATATATGATTGACATATAGACATCGTATATGTTTAAGGTCTACAACTTGACACTTGAGGGATTAAAGAGAGCAGGCTGTTAACTCTTTGAAACCTGGAAACTTGGCCGAGCGCGGTGGCTGAAGCCTGTAGTCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCGTCCTGGCTAGCACGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAGAAGATTGGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTGGTCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGATTGCGGGCATGCGCCCCCATGCCCAGCTGGTTTTTGTGTTTTTAGTGGAGACGGGG 5 0 5' arm Macaca_fascicularis mirnest Metazoa_SRP 4e-17 ppy-mir-1268 0.0000001 -77.9 ........(((((((((((((((((((((((((..((((((.((((((((.((((...((((((((((((.................))))))))))))...)))).)))))))).))))))))))))))))))))))))))))))) (-77.9)