mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCAGT TGGTTTCACATGGTGGCTTAGA TCCTCTGGAAGCTGGTTTCACATGGTGGCTTAGATTTTTCCATCTTTGTATCTAGCACCATTTGAAATCAGTGTTCTAGGA TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTGTTGTATCAACCTAGAGGCATGGATAATGGGTTGTGCTGTCAAATTTCGAGGTTGGGGGGCCTATAGTTTAGTTGTTTTGTGGGTCGCCGTGATGCCATCACTCATTTATATATATAGATGTAATGTTAACAAAAACGTATGTGCATTGCCTCAATATTTATGTATTATAATAAAAGTAGTGATAAACCAAAACCAAACATTTCCTCCCAGGCAACATAAAAGAAAGCTTCAAACACATGGATTGTGAAGAAGGCACCAACACAGGTGTGTGTCTTCCTCTGGAAGCTGGTTTCACATGGTGGCTTAGATTTTTCCATCTTTGTATCTAGCACCATTTGAAATCAGTGTTCTAGGAGCAAGAATTACAGCACTGGATGTGGAAAACAACCAGAAACAACAGGACCTTGCCACCAATGGCAAATTTTGGTTACATTCATTTGGTGTCTATGCTTTTCTGAAATGATTTTCAAGCTATAACTTTAGATGAGCTTAGTTTACAAGAACACTGAGCATTTGAAGTTAATGATCCAACTAAGGACAAAGTAGCATGGTTTCAATTCAATAATATCACATTACCTTTCTAAAGCAAATGAACTTGTCATCTATATAGGTCCTTGGCTTCCCAACTATATTTCCCAGAATTCTGCAGGAAACTGTCACACATTAGCAAAGTGAGAGCATCCATTTTAGACCAGTAATGTGATATTGTAGTCTTAACT 1 2 3' arm Anolis_carolinensis mirnest mir-29 6e-27 eca-mir-29b-2 1e-36 -27.5 ((((..(((.((((((((((.((((((..((((((..............)))))))))))).)))))))))).))).)))) (-27.5)