mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGGCATACGGCATGGGAAA TCCTATGCATATACTTCTTT ATCTCTGCTCATTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACTTCTTTGAGAATCTGATCTAAAGAGGCATACGGCATGGGAAAATGGGGCAATTGAGGTATT GATTTAGAATCCCAGGCAGCAAATCAGGTGGCTTGTCATGTCAACATCTGTGGAAGCTGCTGAGATTTTCATCAATCTCTGCTCATTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACTTCTTTGAGAATCTGATCTAAAGAGGCATACGGCATGGGAAAATGGGGCAATTGAGGTATTCCTCCACCATCCGACTCATCTTCATGAATCAGCTTTTGAAGGTATTGCCATTTGAAGTTAACACCTGCTAAATGGACTGGACAGTTTTTTTTGGGTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTGCAAAGTGTATATTTCAGCCTTGCATGTCAGTACTTTTTGCATCTCACTTAGCTTTTATGTGAATGGCTATTTACAGATGCTTTCTTAAGTCTGCATAAATGTCTTCATATTGTCTGTAGACATATATTATGACTTGCATAGAAGACTGTCAATCCTTTTAACAGCTTCTTAGCAAGCAAAGTTCAGCAGGAGCAGTTTATCCTTCCATAAGCGCTTGCTGATATAAAACTAACAGCAATTGTTCATGTCTACCAATGCAACATAAATGTAATGGAGGAGAATGTTATGTTGTTATTTGCTCATCACAAGCCACAAAATTAATTTCTTCTTTGTTTCCTCCACAGGCTATTTTTCATGCAATGCTCATTGTTTAAAGACAAGTTGCATTAGCGGATTCTTTCATTGCTTTTCACCCTGAGTCCTCTCGGGGAGATAGGACAGAATATAAATAAAGTCTAAGTATTATTATTAC 2 1 3' arm Anolis_carolinensis mirnest mir-202 3e-26 gga-mir-202 1e-28 -35 (((((.....((((((((.(((((((((((.(((.(((((((.(((......)))))))))).)))..))))))))))).)))))))).)))))... (-35)