mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGACTGTGAGCTCCTTGAGA TACAAGAAGTCTACCTGTCTTTC TTCCTTCAAGTTTTAGCTAAAATCNNACCTTCTACAAGAAGTCTACCTGTCTTTCTTAGCCATCCTGGGCACATCTTGTTTGTGCAGAATTGTTTGCATATTTTCTCCCCATTAGACTGTGAGCTCCTTGAGATCAGGATGATNNTTGGCCTTTTTTGTATT AAGAAATGGATTCCTTGCCACAAGACACTGACTTTTGTTTTTACTACAGCTATCCTTTCTACACTTGTAGGGGTTAGGGGTGTGGTGCTGCTGTGATCTGGAAAGTCTATGTAAATTTTTTGCTCCTCCTTTCATATCAGAGAAGTCTGAATTTTTTTCTTTTTCTTTTCTAGATTGTTTATAACACCTTGTTATAAAATTTGGCTTGAGATTATACAATACTATACATGTATTTGATGTTTGAAAGTTGGTCATTCAAATGGCATGTTAAAAAATTAAAGATGTAAATATGTATGAGGTTTTATTTAACTTCAAAACATTTTGAAATGAAAAGGAGACAAAATTTCTTGTTGATTTTCCTTTTGTTTTTAAAGTAATATAGGATATAATGATAATTCCATCCTAAAGAGACAGTTTTCACAAAGCTTCACTTTATCACAAGGAAAATTTTTCTCAATGACAGGATTTCATTCTATGGCTATGCCACATACTTTGTGATCCAATGACATTGGCTTCATTGTTCTTCTTCACACAAGACATTTCATCTCCCAATTCCATTCTTTTTTACCAGCTGCTCCTCATACCTGGAACTCTCTCCCTTGTCATCTCTGCCTTCTGGCTTCCCTAGCTTCCTTCAAGTTTTAGCTAAAATCNNACCTTCTACAAGAAGTCTACCTGTCTTTCTTAGCCATCCTGGGCACATCTTGTTTGTGCAGAATTGTTTGCATATTTTCTCCCCATTAGACTGTGAGCTCCTTGAGATCAGGATGATNNTTGGCCTTTTTTGTATTATCAGACTAGCCAGTGCATAGCACCTANTAGAGTCNNAGATGCTGTGCTGACTGACTGTCATGANNCTATGACTTGNAGAGC 4 2 3' arm Trichosurus_vulpecula mirnest mir-708 0.0000000006 mdo-mir-151 0.000008 -32 ......((((.....(((((.(((...((((((.((((.(((.(((..((((.............((((...........((((((((....)))))))).......))))..)))).))).))).)))))))..)))..)))..)))))....)))).... (-32)