mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTGGCACGTAGTAAGCACTT ATTCCTTCTATGTGCCAGGCA TCAACAAAGTGCCTGGCACGTAGTAAGCACTTAATAAATTTTGATTGATTGATTGAGTTCTGAACAAACTTCCAACCAATGAGCAGACCTTCATAATAAGGAAGAGTTAAACCATAGCAACTGATGCAATAGTCACTCAAAACATTTTTATTAAATTCCTTCTATGTGCCAGGCATTGTGCTT TTCTCAACAAAGTGCCTGGCACGTAGTAAGCACTTAATAAATTTTGATTGATTGATTGAGTTCTGAACAAACTTCCAACCAATGAGCAGACCTTCATAATAAGGAAGAGTTAAACCATAGCAACTGATGCAATAGTCACTCAAAACATTTTTATTAAATTCCTTCTATGTGCCAGGCATTGTGCTTAGCATTGGGGAAGAGAAGAAACGATAGTTCCCGCTGTCAAGGAATTTTCAGTCTAATGGGGAAAACAACACTCAGAAGGAAGCTGAAAAGCATTGGCAGAGATAACCAGTAAGGTGGCATGATGGAGAAATCCATATGGAAAATGGAAAGACGGCTGGTTGGGGCACCCTCCTCAAATGAAAGAGTTCTCAGCTCTCTGCCCTCCAATCAGAGGGAGGAAGAAACTCAGGGCAGTTGAGGAAGTATAAGTTCCAAGGATGCTGTGATCTTTCAGGGGATACTAGCAAGGTGCGAGTCCTAGAGCTTATGGGATCTTGCAGGATGGAGAGGTCATAGGGACATGATGGAGAAGTCCAGAGAAGTGTGCAGCCAGGAGAAAAATGAGCAATTGCATCTGACAACAAATGCAACCCTCTGCACCACTAGGCCCTCACCTCTCTGAGGAAAGGAGGAAGGTGTACTGCCCCATCTCTTCTCTGGGGCCAAGAAGGGTAATTACAATGATACCACATTAGATTTCATTTTAGTGTTCTTTTCAGTTGTATTATTATAGCCATTGTATATATTATTTTCTAACTCTTCATCCTCCACTCTGTATCAATTCTTATGTCNNCCATCTTNNTCTGAATTGTTCNNNTTTCTTC 3 2 5' arm Trichosurus_vulpecula mirnest SNORA7 0.0002 hsa-mir-1271 0.0001 -47.9 ....((.((((((((((((((((.(((...((((((((((((((.((((((..((.(((...(((...(((((.....(((((......))))).....))))).))).)))))..(((.....)))..)))))).))))))....))))))))....))))))))))))))))))).))... (-47.9)