mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCACACTGCAACACTTTAC CTGTTGTGGTGTGCAAA TTTTTGGTCTGGCTGTTGTGGTGTGCAAAACTTCCTATGTTGCTTTTTTGCCACACTGCAACACTTTACAGATGTGGA TAGAGAAGGAACAACTTCTCACACTTAGTCAGTGGGAGAGGAAAGCAGTGCTTTGAAAGTTCCTCCCTCACCTACACAGTAGTCGTCATGTCGAGACCTGCCAGAGAGAGACACATTCTCAAGTGAATCCTGGCTTCTTGGAAGCGCTTGCCTAGACGAGACACAGTGCATAAAAACTTGATGGCTTTTGGGGGACAGGTATGTTTTTCTTGCAGCTGCGGTTGTAAGGTCTTGGCAAGACAAGCAGTGAGGCCCGAATTTTGAACTTCTGATGAGTGTGTAATACGAAGGACCATGTACATTTTTGCTTAAAGGTCCTCAAATGAACACATGAAGAGGTTGCTGTGAACTTTAGTGGCCCTACTGCGCAGAAGCATTCAGATGTCACTTGATGATCTGTAAGGGAACTTGCTGAGTTGGGAATGAACTAGTGAATATGAATGCACATTCCTTGTGGTAGGTTATCACTGGGTGGGTGGCAAGATTTAATAGAGATGGAGTGTGCATTTAATTTTTTTTACCTCACTGGTATTCCTGCAGAAGTGGATAATCATTTTAACAATATTCTTTTCAGCCCATACCTTCTTGGGAATACAATTGTCTAACTTTTTATTTTTGGTCTGGCTGTTGTGGTGTGCAAAACTTCCTATGTTGCTTTTTTGCCACACTGCAACACTTTACAGATGTGGAAGATGTGAAATTTGTCATCAATTATGACTACCCTAACTCTTCAGAGGATTATATCCACCGAATTGGACGAACTGCCCGTAGTACCAAAACAGGCACAGCATACACTTTCTTTACACCTAATAACATAAAACAAGTAAGCGACCTCATCTCTGTGCTTCGGGAGGCTAATCAAGCAATCAATCCCAAATTGCTTCAGTTAATTGAAGACAGAGGTTCAGGTCGTTCCAGGGGTAGAGGAGGCATGAAGGATGATCGACGGGACAGATACTCTGCGGGCAAAAGGGGTGGATTTAATACCTTTAGGGACAGGGAAAATTATGACAGAGGTTATTCTAGTCTGCTTAAGAGAGATTTTGGGGCAAAAACTCAGAATGGTGTCTACAGTGCTGCAAGTTACACCAATGGGAGCTTTGGAAGTAATTTTGTGTCTGCTGGTATACAGACTAGTTTTAGGACTGGTAATCCAACNNGACTTACCAGAACGTATGACAGTACACAGCATATGGAAANNTGTCCCAAATATGCACATGGCNTGACNCNGGCATATGCATATCCTGCTACTGCAGCTG 5 1 3' arm Trichosurus_vulpecula mirnest 100 hsa-mir-3064 1e-24 -22.6 ......(((((..(((((((((((((((((...............))))).)))))))))))).....)))))..... (-22.6)