mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGTTGTTTTGTTTTGTTTAT AAACAAATAAACGTATTTT GCAATATGAAATAAACAAATAAACGTATTTTTTAAAACAAAGCTCTCTTTTCGTCTGAGTTTCTTAAGGATGAAGGAAAACCCAAGTAGGTGGGCATACAGAGAGTGAATGCCTGAATCTGGGTGTTGTGTTTGTTGTTGTCGGGAGGTTGTTTTGTTTTGTTTATCTTAGGTAC GACTGTGCTCCAGTGCCAAATGCAATAAAGAAGCCCTAAGCCAGGGTAATGGTCAAGTAATGGCAAATAAACCGCCTTCCTAGAAGGGGCCTCGGCCTCCGTTGGGAGAAGGATTTTCCTCCTCAGAAGCAATATGAAATAAACAAATAAACGTATTTTTTAAAACAAAGCTCTCTTTTCGTCTGAGTTTCTTAAGGATGAAGGAAAACCCAAGTAGGTGGGCATACAGAGAGTGAATGCCTGAATCTGGGTGTTGTGTTTGTTGTTGTCGGGAGGTTGTTTTGTTTTGTTTATCTTAGGTACTGGGCTGACAAGGTGAGTAGTTTAAGGACGGGAGAAAGGGTTGGCATCTACCTTTCCTACTTCAGGGCCTTTTTTTAAACAGAGAGCAAGTGTAGAAGCAACAAGTGCCCCCCTCCCTGCGGTCTTGCTAATCGCATCGCCTTTTGTGACTTTATGAAACTTATGGGGGGCCGGTAGCTAAGGGAGTTACTGGATGCAACTCGTTCTCTGCTGTGACTGAATTACCGCGCGTTGTCACTTTGGGGAAGTAAGGTAAGTGTGGCTTCGGTGTTTCAGGCT 3 2 3' arm Papio_anubis mirnest 100 100 -40.9 ((....(((.(((((((((.(((((..(((((...(((((.((..(((((.(((((...........))))))))))..(((((.((...(((((((.((.....)).))))))).)).)))))...)).....)))))...)))))..)))))...))))))))).))).)).. (-40.9)