mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTGAATGTCATTTTGTAAT TTAGATATGCATACAGTAGC AGCACATTCAGTGATATCATATTTAGATATGCATACAGTAGCTCATCTTCACTCATGGATATACTGAATGTCATTTTGTAATTTGATAGCTGATTCAGTCT CAGATTGGAACCTACGTACTGTGGACATAGTGAAAAGGGAGTGGGGTTGGGAGTACATTACTAAGAAGAATCTATAAAAGGGCAGAATAATCAAACAGCCTTGACTGAACTGGATGTTGCTGCTGAAGGTGTTTACACCGAGGCAAGCCCCTGTGTAGACAGGTGAATGGCTGCAGGGGTAGGTCACTGTAGGGAGACTCCCACTTTACCACCTGGCTGCCCTCACTGAATGGCTGGAAAATTGAGAGGTACCCAAAGAGTGATAACACATCTGTGGTTTATTTTCCATGAATTTTCTGTCCTTAGTAAATACAGTGCTTTGCTTAAGAATGCTTCTTGTCTTGTTATGAATGCTGAGTTAAATTTAAGAAAATTTTGTAGATTATTAGTATGCTAAGAATTATAGGGTAGCATTATGTACAAATATACCTGTTCATTTTCTTATAAAACAATCTAGGCTGATGAAAACACAATAAATTGGATCTACAGCAGACCCATTAAATACTTATGTGGCATATTTGATGGGCTCTTCAATAAAATCTGAATTATAACAAATTGCCAACAGCTTGGTAGTAAGTACACGCATGACCAGACCCATCTTCATAGATCTCATTTACAAAGTCCGGTTGCTGCAGGAGGCTGAGGAGGGGTGAAAGCACATTCAGTGATATCATATTTAGATATGCATACAGTAGCTCATCTTCACTCATGGATATACTGAATGTCATTTTGTAATTTGATAGCTGATTCAGTCTGTGGCATGTGAGCATGACTAGGTAAAGATCTGT 4 1 3' arm Papio_anubis mirnest 100 100 -21 .......(((((..(((((.(((..((.((((((.(((((....((((........)))).))))).))).))).))..))).))))))))))........ (-21)