mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACATGTGTGTGTATGTATATA TGTATACACACACGCAGATGGAG AATCTGAGCACGTGTATATGTATGTATACACACACGCAGATGGAGCTGACAGCATACATGGCACAGACATGTGTGTGTATGTATATACGTGCACACAACATAAGCA TTTTTGAATAAAAATTCTTCAAGAGGAAATCCTGGCTTCATTACAATTCTCTTTTTAATCTGTTAAAATCCATCCAAATTTGCTTTCTCTAATTGCATAGGAGATTTAGAGAAACGTCCAAGAATCTCCAGGACTTGTAACCTTTTTTTTCCTTCACTTGTTTCCAAACTGTGTCTGTGTTGTCAGACAAAATATTGATATAGCTTTGCTTAGCTAGATTTAGTAGAATCTAGGACAGTGATTTATAGAGTAGAGGCAAATCCATGCTAAACCTCAAGGTCTGGAAGTTTAAGGTTTATGTTGATATCTATTTGGATTGGTATTTCCTCTACTTGCTTACAAAAGTAAAATGATGTGTGAATAGGTAACCAAGAAACACAAAGCATAATGTTTAACATTACTGTGCTTGCCGCTTGCATATTAGAAGGTGTGTTAGTACTTTAAGGATTCTCGAAGTGAAAACATGTCAACGCAATAAAGAAGGGCAGAGTAGTGCTGAGGGTAAACTGCAGAATGAACAACATCTTTTTAGACTGAGAGGGACAGAAAGCAAGCTGGAGGCAGATGAATTTCATATGAGACTAAAAAAGGAAGTTTATAGCACATCTGGAATCTGAGCACGTGTATATGTATGTATACACACACGCAGATGGAGCTGACAGCATACATGGCACAGACATGTGTGTGTATGTATATACGTGCACACAACATAAGCACATGTGT 2 2 3' arm Papio_anubis mirnest 100 100 -33.3 ...........((((.((((((((((((.(((((((((..((...(((...((.......)).))).))))))))))).)))))))))))).)))).......... (-33.3)