mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCATCTATCTTGAAAAT TGGATATTGAAGGATGCTGTAAT TCTATTCATTTTATGGCATCTATCTTGAAAATAATCTTGTATTGGATATTGAAGGATGCTGTAATTTGGAAAT CTGTGTTTTAAAAATAATTGAAATTTATCTTGCCATATCTCATAATTTCCTGCAGAAATGACTGAGCTAATCTTAAGAAAATATTCATAAAATAGGAGCACATTTAGTTGAGGTATACAAGGTAGGACTGTAGACAAGACTCTCTATTTAGCTTTAGTGAATTTCAAAAGTAATGGGTCTTGAAGTGTAGATTTGTATTAGTAGCTTGAAAAAGCTTAATCGCATGCAGTAAATATTTTTATTACCAATAAATTTAAATTTTTTTAAGAAAAATATTTTTATCCTAGGGCCAAGTGTTGCCTGCCACCAATCAGTAAGTTAGTCTATAACAAATTTTACCTTAACAGTTTTACCACCTAGTAACAGTCATTTCTGAAAATATGTTGGATAGAAAGTCACTCTTTGACAAATGTGTTAGGATTTGCCTTTGTGCCATCTATTCATTTTATGGCATCTATCTTGAAAATAATCTTGTATTGGATATTGAAGGATGCTGTAATTTGGAAATTAACATGATTTCTTAAATTACCTTTATGAAATATAGTTTTGTATAATAGCATAGATTTTCCTTCAAAAAATGAACATTTATATATCTACAAAAATATGGAAAAGTGTAATTTGAAAGCCTACTTTCTGAAGAAAATGTTGGGGATTCTTTTTATCATGATTAAATATCAAAAACTTGCCCTATGAAAACTTTAAATTTCTCAAACATTTGAAATACTACTGTATTTATGATTTATTGAGAATAAAATCCATTTTGAAGTATAAAATTCTTACATCTGATTCAGTTTTAAGAAAGCATATAAATGAACTAGAAGATATT 4 2 5' arm Papio_anubis mirnest 100 100 -19.3 ....((((..(((((((((((.((.((..((((......))))...))..)).)))))))))))..))))... (-19.3)