mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGTAATTGTGGTTTTTGC AGAAACCACAGTTACTGTTGT GGCAAGTTATTAGGTTAGTGCAAAAGTAATTGTGGTTTTTGCCATACTTTTAATGGCAGAAACCACAGTTACTGTTGTACCAACCTAATAGCAAAC CTTTTATAACTAAAGTTATGAGATAGTGCTGCCTTTCTTACCCTCAGATTATAATTTGATAACAGAAATCAGATAAGTACCTAGGTAAAAAAAAAAACCCTATGTCATTCAGCCAGCAGTTTATTCATTCACCTTAGAGAGCGCATCAGTTTCCATCAGGTGTTTCCCATCTGATGCTCTCAATCACCCGGAAGTAAATTTATGAAGAGGGAAGTGGGGATCAGAAAAGTTCTGGAATTAGTACAGATCTCCTGTTTTACATACTGGAGTCTGGGGGTGTGTCGGTGAATACATAGAAATCATTTGCCCTAATGGAGATTTCATAATGCCCAAGTATCATTTCCAGACCATCCTTATGAAGCCAAACAATCCTGAAGAAAAAGAGCAAATGCGCTGGTGAAATGGCATGGGCCCCGGGCGCGGTGATTCACGCCTGTAATCCCAAAGTGTTGGAATTACAGGCATGAGCCACTGCCCCCAGTTGTCTGCACAGTGATTTAACAAATGGTGCCATTTCTCAGTAAAATGGTAAAGAACCAGCTCTAGATGCAGAATGCCTGGGTTAGAATCCAGAAATTACTTGTAATTTCTGGGACTTTGGGCAAGTTATTAGGTTAGTGCAAAAGTAATTGTGGTTTTTGCCATACTTTTAATGGCAGAAACCACAGTTACTGTTGTACCAACCTAATAGCAAACTTCTCTGCCTCAGCTTTCCTTCTCTGCTAAATAGGAGTAATAAACTTTACTCCAACCCCTCATAGGCTTGTTGTGAGGATGAAATGAGTTAAGATGTTCCTAGTGTGTAATGTTTCCATAGAGTACCTGCTATCACTGTTGACGTTGTTGTTATTTAATTGCCTCAGACTGGTTTAGAAATGAGGGACCGAAGTTAAGCATGC 1 0 5' arm Papio_anubis mirnest mir-548 4e-19 hsa-mir-548aa-2 5e-18 -50.4 .....(((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((((.......))))))))))))))))))))).)))))).))))))))))).... (-50.4)