mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAGTAGTCTGCACATTGGTT CCAGTGTTCAGACTACCTGTTC TGCTCCGTCGCCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCAGGACAATGCCGTTGTACAGTAGTCTGCACATTGGTTTTGCACACT CAGCGCAGCAGAATTCAGGGGGGAAAGCTGAATGCAACCCCTGGTGCAGGAAGGGAGGCTTTTCCTGAGGACCGGGAGAGGATTTTAAGTACATGGAAGGAAGCTTCTGGAGATCCTGCTCCGTCGCCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCAGGACAATGCCGTTGTACAGTAGTCTGCACATTGGTTTTGCACACTAGGGACCAAGAAGCCCTCGGGGACACTGCTGAGAAAAGACTGCCGAAAGGAAGACTAGCGGGAGATATACAAATATTTTAGGGATCATGGAATCTATTCCAGAGGAAACTAACCAACAGTGAGCATCTTCAACTAAAACTACCCCTGGATGTAATGGTTGCATGCATCATTCCTTTAATTGAGCAGAGTTAACTGGATCAAATTATTTATGGGAGAGAGAGGAAAAGTTATAAAGAATTTTAGTAATTTTTAATTTCCACCACTATACTCTTTGTAAGTGAATCACTCTATAATTACTTTCTGTTGCACTGAATGCAGCAACAGTAACACAATAGTATTTTAAGGCACTGGTTTTTGGCATACTCTAACCTTGAGGCTATTTAAATAACAGACAAGTTTACTCATGTTTATTATTCTGTCAAGGAAAAAAAGTTCCTTTACTCGGAAGTGATGGCCAGAAACAGAATCAGAAATTTACTTTCTTGAAATTACATAAGTACACACAAAATGGCACTTACCAGCTTTTGTAAAA 3 1 3' arm Papio_anubis mirnest mir-199 4e-31 lla-mir-199a 8e-35 -24.5 .........((.(((((((.((((((((.(((.(.((......))...).))))))))))).)))))))....))..... (-24.5)