mature_miRNA	miRNA*	pre-miRNA	EST_contig	mismatches	bulges	arm	species	source_database	RFAM_best_hit	RFAM_lowest_evalue	miRBase_best_hit	miRBase_lowest_evalue	folding_energy	secondary_structure
TTTGGATTGGAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCAATAG AGAAGGTGGGGGGTTAGGAATGGAGCTCCTTGAAGTCAATAGAGTTTCTTGCTGGGTATATTGAGCTGCTTGGCTATGGATCCCACAGTCCTATCCCATGGTTGGAGGGATAGGCTTGCGGGCTCCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTTTAAAAGTAGAATCCTTGTTTGGATTGGAGGGAGCTCTACATCTTCTCCTTTCTCACT GGCACGAGGGCCTCGGTAGGTAGGGTTGTTTACTCTTGGGGGTCTCCTTGGTTCACACCAGGAGCGTCTCCGAGGCTTCAAGTTTTGGGTTTTAAGATCTACTTAGCACTCGGACCATCTTGTAGGTGAAGTCGGGTTAAAGTATGGTCTGGCTTTTGCTTTAAAGGGTCTTGGATCTGTTCCGAGTTTTTTGTATTTTAGTCTAGTTTCATGGATTTGCTTTTGTGATGGAAAAAAATGTTTGGCTTTTTTCTCTAGTGGGGTTGAGAGATCACATCTTCTCATCTTAACTAAAGATTGATCGTTTACTCAAATAGTTGTGTACTTTCGGTTTTCCAGTTTATAGGGGAAAAGAAAAGATGTGTTTTGCTTTTGCTTTTAATCTTGCTTCTGTATTTTCTTCCCGTTTATGGTAAGTTGTCTAGGGTTAGGGTAAGTGTTTGTTTAAAGTGGTCAGGTTTTAGTGAATAAATATGGCTATTAGGAAGAAGAAAAAGAAGAGCATCAGCCCAAGTATTTAGATGTAATCCAAAGTAAGAAGGTGGGGGGTTAGGAATGGAGCTCCTTGAAGTCAATAGAGTTTCTTGCTGGGTATATTGAGCTGCTTGGCTATGGATCCCACAGTCCTATCCCATGGTTGGAGGGATAGGCTTGCGGGCTCCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTTTAAAAGTAGAATCCTTGTTTGGATTGGAGGGAGCTCTACATCTTCTCCTTTCTCACTTCATCGTCTACCCAAAAATGATGTGATCTTTATATGCTACACTTTTACCTCTTTTGTGCTGGTGAATCTTTTCTCCTTCATGGTCTGGGAAGTTTAAGGGTTGAATGGAAATTATTTTGCCTTGGGGGGTTAATGGGATTAATAATTGCATACTGTTGTGAATGGTGGATGGGACTTGAATTTCTTGTTCCCCCTTTTGGTTTTCCTTATAATTTTTGGGGAAAGGTTGCTAAAAATGGCAATGTTTACCCCGGAATAAACCAAGGGAAAAGCAAAACGAAATGGCGAAAAGAAAATCTGGGGGTCCTTTTCCTTAAATTCCGCTGGCTGTTGCGGGCCCGGCTTTCAAAATTCTTTTTTTAATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATTTTTTAAACCTTTTCCTTTTTTTTTTTAATCTTTTAAAGGTTCCCCGGCCCTTTTTTTTTTTTTTTGGCTAAGGGTTATTTTTTTTGTCCGGGCGGGGGGGGGGGTTTTTTTGAAAAAATGGGGGGTGTTTTTTTTTTTTGGTGGGAAAAGGGGGGGGAAAAA 5 1 3' arm Gossypium_hirsutum mirnest MIR159 0.00000000000001 ptc-MIR159c 8e-16 -73.5 ....(((((((((..((((.(((((((((((....((((..(((.((((....(((((...((((((.((.((.((((((.(((.(((.((((((((.........)))))))).))).))).)))))).)).)).))).))).)))))........))))..)))..)))).....)))))))))))..))))..)))..)))))) (-73.5)