mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTATAAATGTACACACACT TGTGCTGTAATGTATATGTGA AAAGAATTTGACTGTGCTGTAATGTATATGTGATAAATAAAGACTTCTTCTTATGTATAAATGTACACACACTCAGGAGCAC GGGAAGAAAAGAATTTGACTGTGCTGTAATGTATATGTGATAAATAAAGACTTCTTCTTATGTATAAATGTACACACACTCAGGAGCACGAGTAGAATATGAATGAACAGGATTTTCATGAACACCAAATTTCTTGTGTAAACGCTCGTACAAACGATTTACACACAAACCCGTTCATATCCAGTTTTATAAATGAGGCACATTGAAAAAGCATTTGACAGGGTTGAGTGGGAGTATTTGTTTGCAGTCTTGAGGAAGTTCGGATTTGGGGATAAGTTTATTTCTTGGATTAGCCTCCTTTACTCATCCCCTAATGCCAGGGTTCAGACAAGCGATATTTATTCGGATTATTTTGCTCTCGGACGAGGGTGTCGTCGAGGCTGTCCTTTATCCCCTCTGCTTTTTGCTGTCGCTATCGAGCCGCTGTCTATTGCACTAAAATCTTCTCCCTGGTTTAAAGGAATAGTTCGATACGGTGTAGAATACAAATTGTCGCTATGTGCTGATGATTTGTTATTGTATGTAACCGGTCCTGTTGCCTCTATGCCAGCTGTCTTGGGTGTTCTGGAGTCCTTCGGTGTCGTCTCTGGTTATAAAT 4 2 3' arm Ictalurus_furcatus mirnest 100 cfa-mir-568 0.001 -15.2 ......(((((.((((.((((...(((((((((.((...........)).)))))))))....)))))))).)))))..... (-15.2)