mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGAGTGTGTGCATGTGTGT GCACTGACACCTACTCTAAAG TAAAGCCTGTGTGTGAGTGTGTGCATGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGGAGGCCCACCACAGTGTTTCACCCACGCACTGACACCTACTCTAAAGGGGAAAGG AAGTTGTTGTTGTTTTCACATGTTCAGGGATTTGAAGCGCAGTAAACAAACATCAAAAAGCTGATTCGGACAAAATAAAATAAAAAACAGGCAGGAAGTGGCATTGAGTAGAAGCGTCTGTAAAGCCTGTGTGTGAGTGTGTGCATGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGGAGGCCCACCACAGTGTTTCACCCACGCACTGACACCTACTCTAAAGGGGAAAGGAAAAAAGCTTGTGCGAGCAAACTAAGCAGAGCAGCGCTCAGGAAGAGCTTCAATACTCAACACTGGCTGATTGCCTAATTTTATGCATCACAGCTTCTTCTTTTAGTCTCTGTCCTACTTTAACCTACTGCCATTCATGTGTAGTTAATGTCCTTACTCAGACTTCTTAAGGAAAGTCCCAAAAGCCACAATGCACAAAATCCAGGTAGCTTTCATGATAACAGCTAAAATAATAAAAATCACAGTGCTGTTGAATTCTCCATTCTGATTGGTCAGAAGGTGTTCCAGCTCTGACGGTAGTTCCGCGCTTTCAGGAACAGGAACATCTTACACAAGCTCGCCTGTATGACGGATGCTCACGATTAACAAAACATGGGCACTTGTTGATAATATTTTCCTTGCGGAGGTTTATTTAACATTTATGGAAGGAGTCTCCAGTGTTAGCGCATTGTAACTGTCAAGAGGGAAAGCTGTAACTGAACATTTTTTCCACCGCAGAAAGCTACGGCAAAAACTTTACGCAATTTTAAAATAAACAAACAAATAAATAAATAAATCTTTGCAGTTATGATTTGTCTCTGTTTTTCCCCGTTAAGCCAC 4 2 5' arm Ictalurus_furcatus mirnest 100 100 -30.2 .....(((......(((((.(((((.((((((..(((......((((.((((....))))))))......)))..)))))))).))).)))))....)))...... (-30.2)