mature_miRNA	miRNA*	pre-miRNA	EST_contig	mismatches	bulges	arm	species	source_database	RFAM_best_hit	RFAM_lowest_evalue	miRBase_best_hit	miRBase_lowest_evalue	folding_energy	secondary_structure
TGCTGTTGGAGCATCATCAAG TGATGATGCTGCAGTGGCAAT GATTGCACAACAGTCACTGTTTGCTGTTGGAGCATCATCAAGATTCACAATTTTAGGGTTCTTTTTTGATTGATTTGATCAATCAGCCTTTTTATGATTGAGAATCCTGATGATGCTGCAGTGGCAATAAGTGGCTAAATATTCCA CTTCAATGTTACCATTCTTTTCTTTACTTTAGCTTTGGGTTTTTGTTTTTATAAGCTTTGCTTCATGTTCTTCACTTCTTTTTTGAAGCATTCATTTTGGGTTTCAACTTTTTTGGGCTAGGGTTAGGGTTTTTTTTGCATGGGAATGCTATGATGATGGTGGTGAGGATGATTGCACAACAGTCACTGTTTGCTGTTGGAGCATCATCAAGATTCACAATTTTAGGGTTCTTTTTTGATTGATTTGATCAATCAGCCTTTTTATGATTGAGAATCCTGATGATGCTGCAGTGGCAATAAGTGGCTAAATATTCCAATTTACAAGCAAATGCTACCACCAAAAAATTACAAAAAAAAAAAGAGGGAAAATAATGAAGGTGAATTAATCCTCTCTTTTGCTTGTATCTTTTTTGTTTTTGAAGAATACATTTAATGCTAATAACCTTACAAAAATGTTTAATATTTGATAATATTATTAGGGTTTTGCTATATAATCCAAGCTGTAATATACTGTAATAATCATATATCTATCTTAGTTTTTTTTTTTAATTTCAGTTTATATTATGTTATTCTGACCCTTTTTGTCAGATGTTTTCAGCTGCAAAAAAAACTCATTAATTTCCATTTTGTGTTTATATAATTTATATGTTTTTTTTCAATTTCTACTGATGATGCTCTGCAGGGAATATATAGCAAATCTCTTATGTAATCATTTTGGTTTTCTGTCAGCAATCTATAATCATTTTGTTAACAATGTTGTACATTAATTTTTTTCCCTTTTTCTTTGTTTATTGATGTAATTTTTTAGCCTTTTTTATGGGAATATTTTCAGTTAATTCTTTTTCAATGTATTTTATATGTAATTTTTTCACATTTCTACATGAAGGTTTTCATCTTTTTTGGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2 0 5' arm Gossypium_hirsutum mirnest mir-172 0.000000009 ghr-MIR172 1e-66 -51.9 ...........(((((((..(((((((((.((((((((((.(((((.(((((..(((((.......((((((((...))))))))))))).....))))).))))).)))))))))).)))))))))..))))))).......... (-51.9)