mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATGGATTTTTGGAGCAGG TGTGGAACGAGGGTTTATTTT ATTAAATGGATTTTTGGAGCAGGTCTTGGTGAGGAAATACTTGATGGCAGCTTCTGTGGAACGAGGGTTTATTTTT ATTAAATGGATTTTTGGAGCAGGTCTTGGTGAGGAAATACTTGATGGCAGCTTCTGTGGAACGAGGGTTTATTTTTTTGGTTAGAACTGGAATAAAAGCTAGCATGTTTATTTCTAGGCCTACTCAGGTAAAAAATCAGTGCGAGCTTAGCGCTGTG 2 2 5' arm Homo_sapiens mirnest U2 0.00006 hsa-mir-1246 0.0008 -15.5 ...(((((((((((((..(((((..(((.((((......))))....)))..)))))....))))))))))))).. (-15.5)