mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAGCTGAAGAAGGAGAGGCT TCTCTTCTCTTCTTCTGTCT CCCAATATCTGCACCCTTATTTTCTCTTCTCTTCTTCTGTCTCTCTTAAACATATCACCTGTACACCATGAAGATCTTCAACCCTTTCTGAATCGTTTTTCCAAAACGATGAGTGTCCCTCGGACACTATATTCCTCAAAGGAATGAACCTCTCCAATCTTCACCATTCCACATTCTCCCTCGTCTCTTGGCCATACAATTAGCCTTCACAACCAATAATCTTACTAGCTTTCTTTGTTTTCCTTTTCTTTCTCTGGAAACTTCATCCAATGGATCTGAAAAACGAGATGGAGACAAGTTATCGAACAGCGGTAGGATGGTGATCTTTGAAAAGTACGAGACGGGGCGCGTGTTAGGGTAGGGGAACTTTGCGAAGGTATACTACGGGAGGAACCTGGCGACGAGTGAAAGTGTGGCGATTAAGGTGATAAAGAAGGATAGCTGAAGAAGGAGAGGCTGATAGAGCAGATTAAGAGA AATCATAAAAACTTTCCCTAAACCTAACCCAATATCTGCACCCTTATTTTCTCTTCTCTTCTTCTGTCTCTCTTAAACATATCACCTGTACACCATGAAGATCTTCAACCCTTTCTGAATCGTTTTTCCAAAACGATGAGTGTCCCTCGGACACTATATTCCTCAAAGGAATGAACCTCTCCAATCTTCACCATTCCACATTCTCCCTCGTCTCTTGGCCATACAATTAGCCTTCACAACCAATAATCTTACTAGCTTTCTTTGTTTTCCTTTTCTTTCTCTGGAAACTTCATCCAATGGATCTGAAAAACGAGATGGAGACAAGTTATCGAACAGCGGTAGGATGGTGATCTTTGAAAAGTACGAGACGGGGCGCGTGTTAGGGTAGGGGAACTTTGCGAAGGTATACTACGGGAGGAACCTGGCGACGAGTGAAAGTGTGGCGATTAAGGTGATAAAGAAGGATAGCTGAAGAAGGAGAGGCTGATAGAGCAGATTAAGAGAGAGGTTTCGGTTATGAGGCTGGTGAGGCATCCCAACATAGTGGAGCTGAAGGAAGTTATGGCGACGAAAGGGGAAGATATTCTTGGTTATGGAGTACGTTAAGG 4 1 3' arm Arachis_duranensis mirnest 100 100 -118.9 ......((((((....(((((.((((((((((((..((((((.((((.....((((((((...((...))..((((.(((...(((((...((((((((...)))))))).(((((((...))))))).(((((((...))))))).((((.(((((..(((.((..(((((((....(((((((((..(((..........))).((((........((((((((.((..((((((((((..(((((.(((..((((.......))))..)))...)))))..))))))))))...(((....))).)))))))))).))))...((....))...)))))))))...))))..)))...)))))..))).))))))..(((.((((.....))))......))))))))..))).)))).)))))))))))).))))))..)))).))))))))..))))).))))))....... (-118.9)