mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGCGACAAAGCAAGACTCCA GGAGTCTTTTTCTGCACTCCAG CTTTATTTCCCTTTTTTTTGTTTGTTTTTTGTGTTCGAGATGGGAGTCTTTTTCTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTCGAAACTTAA TTCAAAGTCTGATTTTTGTCAGCGCTCTAGAGCAGTCTCACCAAAAGTGTGGTCCACAAGGCAGTGCCAGTCTGTAAGCCCTTTGTTACACATCCATGTCAAGGCATTTACAGAAAGTAAGAATTTAGAAACTTATAGCAGTTTAACAGACTAATTTTATTTCTGTGGGTCTAATAAAAATTTGAGGGATTGTACTTTGCATATTCTTTATTTCCCTTTTTTTTGTTTGTTTTTTGTGTTCGAGATGGGAGTCTTTTTCTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTCGAAACTTAAACAGTCACCTCACAAAAAAGGGTGTCTAAATATTAGTTTCTTAAAAAAAAAAAAAAAG 5 1 3' arm Homo_sapiens mirnest Metazoa_SRP 8.0E-12 hsa-mir-1273 7.0E-12 -34.1 .....((((((((((((((.(((.((((((...((.(((((((.((((((.((.((...((((...))))...)).)).))))))))))))))).)))))).))).))))))))))..))))..... (-34.1)