mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGATTTTTGGATCAGGGATG TCCCTGACCTGAAAACCCAAA GGAATATTTACAGTGTAGTTACTAGTTGAGCATCCCTGACCTGAAAACCCAAAATCCAAAATGCTTCAATGAGCATTTGTTTTAGCATAACCTTTGAACATCATATTGGTACTCAAAAGTTTCAGATTTTGGAGCATTGTGGATTTCAGATTTTTGGATCAGGGATGCATTAGTAACTTTGTCACTTTACAGTGAG TAGGACTAGAGGCTTTTCAGATTTCAGATTTTATTGAATTTTGGAATATTTACAGTGTAGTTACTAGTTGAGCATCCCTGACCTGAAAACCCAAAATCCAAAATGCTTCAATGAGCATTTGTTTTAGCATAACCTTTGAACATCATATTGGTACTCAAAAGTTTCAGATTTTGGAGCATTGTGGATTTCAGATTTTTGGATCAGGGATGCATTAGTAACTTTGTCACTTTACAGTGAGGCCCACTGTGTTGGTACTCCACCTCCTCACACCACCTCCTGCTCTCCCTAGCTCCTCTGCCTGCTCCATTTTCTTGCCAACTGCACTTATTGCCTTACAGTAGACTATGTAATGGATTTATTTATTTGCTATTTCTATGTATTGTCTGTCTTTCATTACTAAATGTAGTTAAATGTAATGCAAGGACAGAAATTGCTCACTGCTGTATCCGAAGCACCCAGAAGAGTACCTGGAACATAGTAGACATTCGATAAATTATTGCTGAATGAATACTGATAGGCTTATTACTAAGTTAGAAGATCCTTGTCTTAATGAATAATATAG 5 0 3' arm Homo_sapiens mirnest 100 hsa-mir-1290 0.000000000003 -59.1 ..............(.((((((((((...((((((((((.(((((((....(((((((.((((((((((.....(((((.........(((.(((((..((((...))))..))))).))).))))).)))))))))).)))))))....))))))).)))))))))))))))))))).).(((((....))))). (-59.1)