mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTTCTATGTGCCAGGCAC GAGTGGTATACAGGAGCTCCACT GACAAGTAGAGTGAGTGGTATACAGGAGCTCCACTATTTTGCAACTTTCCTGTAAGTCTAAAGATGGGTTTATAATTAAAAATTTAAAACAAATTAGAAGCATACACCAAAATCCTTGCATTTACAGATTTAGCGAATATTTATTAAGTGCCTTCTATGTGCCAGGCACTGGACATTG GGCCATTACGGCCGGGGTACTGTGGTTTTGTAAACTGTTAACATAGGGACAAGTAGAGTGAGTGGTATACAGGAGCTCCACTATTTTGCAACTTTCCTGTAAGTCTAAAGATGGGTTTATAATTAAAAATTTAAAACAAATTAGAAGCATACACCAAAATCCTTGCATTTACAGATTTAGCGAATATTTATTAAGTGCCTTCTATGTGCCAGGCACTGGACATTGACAATATTAATAGAATAGTTAACCAGATAG 4 2 3' arm Homo_sapiens mirnest 100 hsa-mir-1271 0.0001 -36.2 .....((..((((..(((((((.(((((...((((..(((((.......((((((((.(((.(((.(((.(((..((...(((((.....)))))..))..))).)))...))).))).)))))))).....))))).........)))).))))).)))))))..))))..)).... (-36.2)