mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGGAAAGCGAGTAGGGACATTT ATGTCCCTGTCCCCTTCCCCCCA TGGTGGCTGTAATCGATCAGTAAAATTAGACAAATTTTAAATGTCCCTGTCCCCTTCCCCCCAATTAAAGTAGATTGGGGGAAAGCGAGTAGGGACATTTAAAATTTGTTGTCCTTACTGTATGCGGGACACTTCAT AGAGGTAATCCCATCTGTTAACACAGAGGAACACTTTTCTTTTTCTTGTTTTTGAAGTGAGTGGTATAAGAATAAGCTTTGGAGGCGACCCCCCGAAAAATGAGCTTGATGGGGATTCGAAAATGTTTACTGGGTATGGTGATTTGGGCCATTATAGGTTAGCCGCAGTCATACAATTGAGGGTATTATTAAAGGAGTTTCATTTTAAGGCCGATTAAGAACTTGAGTGGACTTTGGGCATCATTTTCTGCTAGTATACACTGGCCAAATTTTGGGCTTTGAGAAACTTTTGCGTTTGAGTCCTGAAGCACCGTACTAGAACATGGTGGCTGTAATCGATCAGTAAAATTAGACAAATTTTAAATGTCCCTGTCCCCTTCCCCCCAATTAAAGTAGATTGGGGGAAAGCGAGTAGGGACATTTAAAATTTGTTGTCCTTACTGTATGCGGGACACTTCATTTAGGGCGTGGCTTCAGAAAACAGTCAACCCCTTTTTCTTAACTAGGTAGCGACTAGAACGCTGCGTTCTGGGATACTACCAAGATTTAGGGGAGATAAAGCCCATGCCATCGTTGGCCAAATTGTGACCTTGTTTTCTGTCTGCTGCCTTTGTAGGTTAGATTTCTCCGAATGCTATTTAAGGAAGAANAGAACAAACAGTGGGTGGTTTCTCNTTTTCTCCCCCTCCCTAGTAGCATGGGAGTCTGTTTTCACATGAGACTACTGATATTCTATGGTAGTAGTATGCACTTTTGTATCTACTAGAATAGATGTTTCTGCTGAGTAATCAGTAATGGTACTAAGATATACTACCTGATAGTGCTG 2 2 3' arm Homo_sapiens mirnest 100 hsa-mir-3153 4e-41 -52.5 .((((.(((((......((((((.....(((((((((((((((((((((((..(((.(((((((((......))))))))).))).)).)))))))))))))))))))))....))))))..)))))..)))).... (-52.5)