mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGATTACAAGTGTGAGCCA GCTATTTTTGTATTTTTAGT CCACCATGCCTGGCTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGATTCTGAACTCTTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAAGTGTGAGCCACCGCACCTG AAGGGTTTCGCCAGTGCTGGCCAGGATGGTCTCTATCCCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTGAGCCGTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCGCGCCTGCCCTATTCTTTTATTTTCTTGAGAAAGAGCTTCACTCTTGTCGCCCAGGCTGAAGTGAAGAGCTGCGATCTCACCTTAACATGCATCCTTCGACTAGTGGGTTCAAGCCACTTCTGCCTCAGCCTCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACCATGCCTGGCTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAAGCTGATTCTGAACTCTTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAAGTGTGAGCCACCGCACCTGGCCTGAAATCCTCTTTTAAACCACGTGATTTGGGCTTGATGTGAAAAATATAGTCCTACCATATCTTTTGTTCTTTTCCCATTCTAAAATTATGTGATTCTAGGCTAAATGCAGAGCAACATCCCATTTCACA 4 1 3' arm Homo_sapiens mirnest Metazoa_SRP 2e-21 hsa-mir-3929 0.000002 -34.2 ......(((.(((((...((((((.((((((((((...(((((((......((((((...))))))...)))))))...))))).(((.((((....)))).))).))))).))))))....)))))..))).... (-34.2)