mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGTTGAGTGTTTTCTGTGT AGGAAGTCCTCAGCAGTGT CTGTCCGGGTGGAGACTGAGAAAGGAAGTCCTCAGCAGTGTCAGTTCCCAGAGCTTTGGAAGAAGGACCAGCAGCTCTGTCCNCTGGGAACCTATCAAAAAATGCTGTTGAGTGTTTTCTGTGTCTGTCTGTCACCTGGGCAT TGCCCATGATGATCCCTGATAGCAAAAGGTTTCCTTTCTGAGGCTGCCATATTGCCACTGTCCGGGTGGAGACTGAGAAAGGAAGTCCTCAGCAGTGTCAGTTCCCAGAGCTTTGGAAGAAGGACCAGCAGCTCTGTCCNCTGGGAACCTATCAAAAAATGCTGTTGAGTGTTTTCTGTGTCTGTCTGTCACCTGGGCATGCGGCATATTCCATTAACTACCGTGTGCCCAATTGTCACTTTTCTTTCA 5 1 3' arm Homo_sapiens mirnest 100 100 -51.3 .(((((((((((((((..(((..(((((..(((((((((((..((((((((((((((((........)))).))))).......)))))))..........)))))))))))...)))))...))))))).))))))))))). (-51.3)