mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAACCCTCCAATGACTTCCTA GGAAGTCACTGAAGGGTTTTGA GAGCCTTTTAAAACAGGTCATTCCTCTGCTCAAACCCTCCAATGACTTCCTATTTCATGTCATGGAAGTCACTGAAGGGTTTTGAGTGGAGGAATTACCTAAGGTAATTCCTG GAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCACAGGCTGGAGTGCAATGGCACGACTTTGGCTCACTGCAATCTCCACCTCCTAGGTTAAACACCACTGCACTCGGACCAGCCTCTCTTGCCACCCCTCCGCAACTCTATTCACCATACAGCAGCCTGAGTGAGCCTTTTAAAACAGGTCATTCCTCTGCTCAAACCCTCCAATGACTTCCTATTTCATGTCATGGAAGTCACTGAAGGGTTTTGAGTGGAGGAATTACCTAAGGTAATTCCTGACCACCTGATGTAACACTCTGACCTCCATCCTGAACATTCTCCATTCCTTTCTCTGCTTTAGCTTTCTCCGTGGCACTTATATTTTGTTTACTGTAGGCCTCCCACTGAGATGATTTTTTCCTCTTGCTCAAGGATGTACCCTGAGCCCCAAACTGTGGTGGCACACAGTANGGTCCTCATTAAGTANTTGGTAAGAATGAATGGGATAACTCCCCCAGCTTTCTATAGGGNAAGGGGCANAANCNAATGGCACTTNTGGACCTAAGGGCTNAA 4 1 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-616 5e-28 hsa-mir-616 4e-50 -48 ..(((((.......((((.(((((((((((((((((((.((.((((((((.............)))))))).)).)))).))))))))))))))).)))))))))........ (-48)