mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGGTGCAAAAGTAATTGCA CACTTACTTATGCACCAACCT ATATGTATATAGATGTATTAAGTTGGTGCAAAAGTAATTGCAGGTTTTGCCATAAAAGTCATGGCAAAAACCACACTTACTTATGCACCAACCTAAGATATGTGTGAAACAG TTTTTTTTTTTTTTTCTTCAAAAAGAGCATTTTTAATAGACTAAATACTGGTTATCACTGAGTTTTTGTTTAAGGTACAACAGCAGCATGGTTCAAATGTTACTTGTAGTTCTCGGAAAAATTAAAAATTTTAAGTGATGAATACAGAAAATGTAGGGACCACCTTTCATTCTTTTGAGTACCACTGTTCTCTTGAAAAAATATTCTAACCTTCTAAAATCCCAGAGTTAAGAACCATTTCCAAGGGGAAAAACAAATCCAAGGCCACAACATAACTTCTGAACAAGTGTGTGCGCGTATATATATATGTATATAGATGTATTAAGTTGGTGCAAAAGTAATTGCAGGTTTTGCCATAAAAGTCATGGCAAAAACCACACTTACTTATGCACCAACCTAAGATATGTGTGAAACAGAGAAAAGGATGTCAAGCTACTTAATTTAATTTCTGTAAAATAAACTTCTGAAATTTGAAGCAGACATTTTGCTTGATCAAAATGTGTTCTTCTTCGGGTTGTTTGATCCCCATTCCATGCA 4 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 4e-16 mml-mir-548d 0.0000000000001 -38.7 ...(((.((((.((((.(((.(((((((((.((((((.((..(((((((((((.......))))).)))))).)).)))))).))))))))).))).)))).))))..))). (-38.7)