mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAAGGGGTGAAATTTAAACGT GTTTAAATTACACTCCTTCTGC CGCCCAGCCAGGATCACAGACGTTTAAATTACACTCCTTCTGCTGTGCCTTACAGCAGTAGAAGGGGTGAAATTTAAACGTCTGTGATCCTGGGGTTGT ACGCCCAGCCAGGATCACAGACGTTTAAATTACACTCCTTCTGCTGTGCCTTACAGCAGTAGAAGGGGTGAAATTTAAACGTCTGTGATCCTGGGGTTGTTGAAGATGCCACCCATCTACATATTCTTTCAGATGCACAATATTTCACTGTGTGAATGAAACAGCAGCCCTTCTTACGTGTGCTTTTGGAATTTGAAGATTTTGTAAGATAAGATGAATGCATTGGAACAAGTGATCCTCAATTCTGTGCAGTCTGTGCCTCCGGAGACTGGCGGCTGCCCCTCCCTGTCTAGTCTTGCAAGAGAGGCAGCTGGCAAGAGGACAGAAGCCGGCAGCTGCTGCGTTTTCATCCTGTTTCTGCTCTTGGAGCTGAGGGGGAGAGGTGGCTAGCAGCCACCCAGTGATCAAACTTGCAGCCTGCCTCTCTTGCTTCCTTTTCACAGACTGGAGTGTGCCTGGGTATGGAGAAAGAACATTTGGGGA 1 0 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-3179 8e-39 hsa-mir-3179-1 2e-42 -60.9 .((((...((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((........))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))... (-60.9)