mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGTGAGTTAGAGATGCAGAGCC ATCTGCATTTTAATTCACATGCA ACCAGCATCAGCGTTACCTGGTAGTGAGTTAGAGATGCAGAGCCCTGGGCTCCTCAGCAAACCTACTGGATCTGCATTTTAATTCACATGCATGGTAATGTCTGTAAAGC ATCAAGCTCCGTCCCTGTGACAACGTCCCGTGGACGGGGAAAGCCATGGCGTCTGAAGAAAGGACATTTAAATAGCCACCTGCAGTGTGGATGAAGAGGCTTTAACCAGGTGGTACAGTTCATTAACCTTGATGTGAACCTTGCCACTCCATATGTGGTCCATGGACCAGCATCAGCGTTACCTGGTAGTGAGTTAGAGATGCAGAGCCCTGGGCTCCTCAGCAAACCTACTGGATCTGCATTTTAATTCACATGCATGGTAATGTCTGTAAAGCACTGATGGACTCAAAAGTACTGAAATGACAGGTTCTCAGCTTTGCTGGGAGCTCATTGGGTGACGCTGGGAAAGTCACCCTGGGGTGACTTCTCTGATGTTTGGCTTTTTCCGTTTGTGCTGTCTACCTGCTTGTTGAGGGTGACCCACCCCTGTGTTGCTGTTGATGGAGACCCTGCAGACTCTAGTCCATGCTCTGGTCTGACTTCTGTAAGCACTGAAGATGGGCTGAACCATCGGAGCTTTTGATAAGGATCAGAATAATTCCCTAAAAGCGTGTGGAGCTGCACACAGAGATTGTC 1 2 5' arm Homo_sapiens mirnest 100 hsa-mir-3174 3e-44 -35.1 ....((..((((((((((..(((((((((((((.(((((((.((.((((............))))..)).))))))))))))))))).)))..))))))).)))....)) (-35.1)